地中海贫血检测.md

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背景介绍

地中海贫血 (简称“地贫”) 是全球热带和亚热带地区高发的溶血性单基因隐性遗传病，在中国大陆地贫主要分布在长江流域以南广大省份，其中四川、重庆、湖南、江西和福建的人群携带率为6%-11%，云南、贵州、广西、广东和海南地区的人群携带率高达12%～25%[^2][^3][^4] ，按基因频率估算，中国南方每年出生的病例数为1.29万。由于该病高发区的人群发生率高，且治疗昂贵，$\color{green}地贫已经成为我国$南方控制出生缺陷的重点对象，通过人群筛查和产前诊断阻止患儿出生是目前国内外公认的地贫的首选预防措施。

地中海贫血的类型

血红蛋白（红细胞中携带氧气的蛋白质）由两种蛋白质组成： α珠蛋白 和 β珠蛋白。地中海贫血主要是由于珠蛋白基因缺陷导致珠蛋白链合成减少或缺[^1]进而致使大量红细胞被破坏[^5]。

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人体生长发育不同阶段对氧的需求不同导致血红蛋白类型不同。所以某结构的异常可能会在人体某个生长时期发病。

  • α地中海贫血
    1. 当与α珠蛋白相关的一个或多个基因缺失或改变（突变）时，就会发生α地中海贫血。
    2. 最常见于东南亚、中东、中国和非洲人后裔。
    3. α地中海贫血的几种类型型[^6]
      1. 阿尔法地中海贫血沉默携带者(Alpha thalassemia silent carrier)。一个基因缺失或损坏，其他 3 个基因正常。血液检查通常是正常的。您的红细胞可能比正常值小。作为沉默携带者意味着您没有疾病迹象，但您可以将受损的基因遗传给您的孩子.
      2. α地中海贫血携带者(Alpha thalassemia carrier)。两个基因缺失。您可能患有轻度贫血。
      3. 血红蛋白 H 病(Hemoglobin H disease)。三个基因缺失。这样就只剩下 1 个工作基因了。您可能患有中度至重度贫血。发烧时症状可能会恶化。如果您接触某些药物、化学品或传染源，情况也会变得更糟。经常需要输血。您生下患有重型α地中海贫血的孩子的风险更大。
      4. 重型阿尔法地中海贫血(Alpha thalassemia major)。 4个基因全部缺失。这会导致严重贫血。在大多数情况下，患有这种疾病的婴儿会在出生前死亡。

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  • β地中海贫血
    1. 当类似的基因缺陷影响β珠蛋白的产生时，就会发生β地中海贫血。
    2. 最常见于地中海血统的人。在较小程度上，中国人、其他亚洲人以及非裔美国人可能会受到影响。
    3. β地中海贫血的几种类型[^7]
      1. 轻度地中海贫血（Thalassemia minima）：症状很少或没有。
      2. 中间型地中海贫血（Thalassemia intermedia）：这会导致中度至重度贫血。
      3. 重型β地中海贫血又称库利贫血（Beta thalassemia major (Cooley’s anemia)）。有两个基因受损。这是这种疾病最严重的形式。患有这种疾病的人需要经常输血。他们可能不会过正常的寿命。

地中海贫血相关的基因

地贫表型相关的基因[^8]

Location Phenotype Phenotype(MIM number) Inheritance Phenotype mapping key Gene/Locus Gene/Locus MIM number
16p13.3 Thalassemia, alpha- 604131 3 HBA2 141850
16p13.3 Thalassemias, alpha- 604131 3 HBA1 141800

相关文章

  1. The Thalassemias: The Role of Molecular Genetics in an Evolving Global Health Problem*
  2. The role of molecular diagnostic testing for hemoglobinopathies and thalassemias
  3. Molecular basis of α-thalassemia 。文章提供了几个地贫相关的数据库，HbVar 记录了影响血红蛋白的变异和地贫相关的突变（截至20240325，地贫相关突变有541条记录， ithanet记录了大量突变，同事可以基于突变的蛋白链和地贫类型进行一些筛选，同时提供了一些common的名称，对于初接触的人可以从这里根据常用名称查找具体突变信息。比如常见的 -α3.7、-α4.2、–SEA、和–THAI,其实都是对应一种具体的突变，单纯的看名字可能不明所以，但其实他们就是一些特定区域的deletion，然后得到的别名。
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HBA1/2

α 样珠蛋白基因簇位于 135-155kb 富含 GC、Alu 重复密集和基因密集的基因组 DNA 区域，距 16 号染色体端粒 (16p13.3) 约 150kb。它包含三个功能性珠蛋白基因，即胚胎 z 基因 (HBZ) 和两个胎儿/成人 α 基因（HBA1 和 HBA2），三个假基因，即假 z (HBZps)、假 α1 (HBA1ps) 和假 α1 (HBA1ps)。

检测原理

临床产品信息

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  1. 圣湘生物： α-地中海贫血基因检测试剂盒[^9]. 可检测α-地贫(–SEA、-α3.7、-α4.2、–THAI)。
  2. 博奥晶典：地中海贫血基因检测试剂盒（微阵列芯片法）[^10]，检测类型如下：
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相关专利

  1. 基于二代测序技术检测α和β地中海贫血点突变的方法及试剂盒[^11]
  2. 地中海贫血症相关基因突变的检测试剂盒、检测方法及其应用[^12]

$\color{red}的

业务逻辑实现

单分子检测地贫的业务逻辑资料
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references

[^1]: Viprakasit V, Ekwattanakit S. Clinical Classification, Screening and Diagnosis for Thalassemia. Hematol Oncol Clin North Am. 2018;32(2):193-211. doi:10.1016/j.hoc.2017.11.006
[^2]: 李友琼，何　升，丘小霞，董柏青，陈碧艳，韦　慧，黄秀宁，赵　林，梁　亮，覃　婷，田　矛，黎君君.2010～2019年广西地中海贫血发生现状与防治策略[J].中国临床新医学,2020,13(10):955-959.
[^3]: 揭秋玲,李崎,孙文页,周繇,陈宏健,黄慧敏,卢伟英,马燕琳海南地区地中海贫血筛检者的基因结果分析实用医学杂志202010.3969/j.issn.1006-5725.2020.08.021
[^4]: 邹团标, 姚莉琴, 李智, 徐咏梅, 陆克文, 何磊, 周凤珍, 刘锦桃, 郭光萍. 中国云南省23个民族育龄人群地中海贫血基因检测与分析[J]. 中国公共卫生, 2019, 35(11): 1505-1510. doi: 10.11847/zgggws1117281
[^5]: https://medlineplus.gov/ency/article/000587.htm
[^6]: https://www.hopkinsmedicine.org/health/conditions-and-diseases/alpha-thalassemia
[^7]: https://www.hopkinsmedicine.org/health/conditions-and-diseases/beta-thalassemia
[^8]: https://www.omim.org/entry/604131
[^9]:https://www.sansure.com.cn/sj/index.aspx?itemid1=11&itemid=142
[^10]: https://www.capitalbiotech.com/product/16/%E8%AF%95%E5%89%82%E7%9B%92/%E5%87%BA%E7%94%9F%E7%BC%BA%E9%99%B7.html
[^11]: 基于二代测序技术检测α和β地中海贫血点突变的方法及试剂盒
[^12]: 地中海贫血症相关基因突变的检测试剂盒、检测方法及其应用
[^13]:一文读懂地中海贫血检测技术的来龙去脉

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