常用数据库目录

1. COSMIC

癌症相关的体细胞位点,是整个网站的核心,收录了来自不同研究机构和数据库的体细胞突变数据,并提供了方便的浏览,检索,下载功能。

2. Cell Lines Project

对癌症研究中常用的细胞系样本进行深入研究,分析其突变信息。相比COSMIC, 整个项目中涵盖的变异数据会少一点。该项目网址如下:
`https://cancer.sanger.ac.uk/cell_lines`

3. COSMIC-3D

通过交互式的网页,展现了基因突变导致的蛋白结构域的变化。该项目网址如下
`https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic3d/`
在搜索框中输入一个具体的基因名称或者蛋白名称,可以查看具体的记录。

4. Cancer Gene Census

在癌症研究中,找到相关的突变基因是最核心的目的之一。通过对各种癌症进行调研,整理了一份癌症相关的突变基因列表,这份列表就是Cancer Gene Census,简称CGC。该项目网址如下
`https://cancer.sanger.ac.uk/census`
在CGC种,将所有的癌症相关基因分成两类
- Tier1 : 对于这部分基因,有充分的证据表明,正是由于这些基因的突变,导致癌症的进一步发生。
- Tier2 : 对于这部分基因,只能说在癌症中检测到了大量该基因的突变,但是并没有充分证据表明该基因突变对癌症发生的影响。
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