云服务器(Elastic Compute Service, ECS)

基因分析平台部署过程可能的坑

docker镜像

基因分析平台默认使用

wdl版本

基因分析平台默认支持 v1.0 的wdl语法,

runtime的个性化配置

基因分析平台上有一些独立的资源配置
例如 :
disks 默认是40G,
instanceType 可以直接指定节点类型(而不是内存和cpu数)
software 可以调用一些软件模块

数据访问类型

  1. oss路径中,除了开始的 oss:// 外,后续目录在进行拼接时,需要规避 // 的出现,基因分析平台的数据访问都是基于oss挂载到容器中进行访问,oss中不支持后续路径中 //的存在。

  2. 所有oss中的文件,以文件名结尾,但是所有的目录必须以 / 结尾。 以 / 结尾在分析中会将整个目录挂载到镜像中进行分析,

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