基因分析平台部署过程可能的坑
docker镜像
基因分析平台默认使用
wdl版本
基因分析平台默认支持 v1.0 的wdl语法,
runtime的个性化配置
基因分析平台上有一些独立的资源配置
例如 :
disks 默认是40G,
instanceType 可以直接指定节点类型(而不是内存和cpu数)
software 可以调用一些软件模块
数据访问类型
oss路径中,除了开始的 oss:// 外,后续目录在进行拼接时,需要规避 // 的出现,基因分析平台的数据访问都是基于oss挂载到容器中进行访问,oss中不支持后续路径中 //的存在。
所有oss中的文件,以文件名结尾,但是所有的目录必须以 / 结尾。 以 / 结尾在分析中会将整个目录挂载到镜像中进行分析,