本页为 微 RNA（microRNA，miRNA）主题下独立 Markdown 文档的文件名与主题对照，不包含技术正文。本系列以外泌体 miRNA 测序质量分析为应用主线，前置生物学与测序关注点后文将衔接具体分析流程。
| 文件名 | 内容范围（一句话） |
|---|---|
miRNA-01-生物学背景.md |
miRNA 定义、生物发生、RISC（RNA-induced silencing complex）与靶标识别、功能模式及与 siRNA 的边界；配图 图 1。 |
miRNA-02-与外泌体的关系.md |
外泌体（exosome）作为 细胞外囊泡（extracellular vesicle，EV）的生物学特征、miRNA 分选与分泌机制、细胞间通讯及液体活检语境；配图 图 1。 |
miRNA-03-测序分析与外泌体质控.md |
small RNA 测序（small RNA sequencing，sRNA-seq）在外泌体质控中的关注指标：读长分布、miRNA 占比、污染 RNA、特征 miRNA 签名、文库复杂度与批次对照；配图 图 1。 |
miRNA-04-外泌体转录组与蛋白组分析平台规划.md |
外泌体项目转录组/蛋白组生物信息平台模块拆分：各检测项要解决的问题、主流方法、技术难点与预估开发周期；多组学排期与联合判读。 |
miRNA-05-外泌体多组学生物信息分析平台概览.md |
平台总体架构：公共层、转录组/蛋白组子平台、多组学整合、数据流、联合 QC 判读与系列导航；配图 图 1。 |
miRNA-06-外泌体转录组分析平台.md |
转录组子平台专文：sRNA-seq/miRNA-seq 模块、标准流水线、工具栈与 QC 交付（落实 miRNA-03）；配图 图 1 框架、图 2 核心评估问题。 |
miRNA-07-外泌体蛋白组分析平台.md |
蛋白组子平台专文：LC-MS/MS 鉴定与定量、EV 标志物、污染过滤、差异分析与 miRNA 衔接；配图 图 1 框架、图 2 核心评估问题。 |
miRNA-08-蛋白质组学实验与数据分析入门.md |
零基础入门：蛋白组实验（提取→酶切→LC-MS/MS）与分析（搜库→FDR→定量→差异→富集）通俗讲解；外泌体注意点；配图 图 1。 |
miRNA-09-单细胞测序在外泌体研究中的应用场景.md |
scRNA-seq 分析全流程（§1 每步目标）及与 bulk EV 联合的六大应用场景；配图 图 1 分析流程、图 2 应用场景。 |
miRNA-10-外泌体生物学功能与生命周期.md |
外泌体生命周期（发生→分泌→摄取→降解）与生物学功能（通讯、免疫、修复、肿瘤、神经、液体活检）；配图 图 1–3。 |
miRNA-11-外泌体综合导读：临床、药物与评估体系.md |
综合导读：临床/药物应用全景、分场景评估逻辑、方法–指标–生物学解读主表；配图 图 1–2。 |
miRNA-12-MISEV2023指南汇总.md |
MISEV2023 中文速查：五核心问题、命名、前处理、五组分蛋白框架、表征/功能/体内研究、Checklist；配图 图 1。 |
miRNA-13-生物药研发中的分子功能与生物表征.md |
生物表征 vs 分子功能边界；§3–§5 转录组/蛋白组表征一般关注的分析内容与交付物；药物类型对照；配图 图 1。 |
miRNA-14-生物表征多组学分析平台分阶段开发计划.md |
全新项目规划建设：对齐 miRNA-13 L1–L5 与五类表征服务包；图 1 整体架构路线图（无时间轴）；模块×层次×交付物×KPI。 |
段末注释：EV 为细胞分泌的膜包裹颗粒总称，外泌体为其经 多泡体（multivesicular body，MVB）途径释放的亚型；sRNA-seq 指针对 ~18–40 nt 小 RNA 的二代测序建库策略。