抗体-02.指标-03.SPR与BLI亲和力检测原理

表面等离子体共振(Surface Plasmon Resonance,SPR)生物膜层干涉(BioLayer Interferometry,BLI) 是抗体研发中测定 (K_{\mathrm{D}})(k_{\mathrm{on}})(k_{\mathrm{off}}) 的两大主流 实时、无标记(label-free) 平台。二者均记录结合–解离全过程的 sensorgram(传感曲线),以 1:1 Langmuir 或扩展模型拟合动力学常数,被业界视为 (K_{\mathrm{D}}) 表征的 金标准(相对 ELISA (EC_{50}) 等终点读数)。

本文属 指标子系列,在 抗体-02.指标-01.亲和力指标总览抗体-02.指标-02.EC50与KD的测定与换算 基础上,专述 SPR/BLI 的 物理原理、实验机制、数据解读、优劣势与局限性;结合原理见 抗体-03.互作-01.抗体抗原互作原理介绍;测定条件对读数的影响见 抗体-03.互作-02.影响亲和力的因素 §6–§7

段末注释Sensorgram 为结合信号随时间变化的曲线,通常含 结合相(association)解离相(dissociation) 两段。

读前说明

  • 默认讨论 可逆、非共价、单价或可控价态 的抗体–蛋白抗原结合。
  • 文中 Ligand = 固定相分子,Analyte = 溶液中注入/浸泡的分子;抗体与抗原哪端固定需在报告中明确。
  • 动力学拟合默认 1:1 结合模型;双价(bivalent)模型在 §6 单独说明。

图 1 SPR 与 BLI 原理对比(科普示意)


1. 共同框架:实时动力学能测什么

1.1 可逆结合与平衡常数

[
\mathrm{L} + \mathrm{A} \rightleftharpoons \mathrm{LA}
]

[
K_{\mathrm{D}} = \frac{[\mathrm{L}][\mathrm{A}]}{[\mathrm{LA}]} = \frac{k_{\mathrm{off}}}{k_{\mathrm{on}}}
]

SPR/BLI 直接观测的是界面处 复合物量随时间的变化,而非终点信号。拟合得到 (k_{\mathrm{on}})(结合速率常数,单位 M(^{-1})s(^{-1}))与 (k_{\mathrm{off}})(解离速率常数,单位 s(^{-1})),再由 (K_{\mathrm{D}} = k_{\mathrm{off}}/k_{\mathrm{on}}) 得到平衡解离常数。

1.2 典型 sensorgram 形态

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响应 (RU 或 nm)
│ ╭──── 稳态平台 (Req) ────╮
│ ╱ ╲ 解离相
│ ╱ 结合相 ╲
│ ╱ ╲___
└──────────────────────────────────────────► 时间
注入 analyte 换 buffer 清洗
阶段 物理过程 拟合参数
Association Analyte 扩散至界面、识别、复合 (k_{\mathrm{on}})
Steady state 结合与解离达动态平衡 (R_{\mathrm{eq}}) 可与 (K_{\mathrm{D}}) 关联
Dissociation 换 buffer,复合物解离 (k_{\mathrm{off}})

全局拟合(global fit):对多条浓度梯度的 association + dissociation 同时拟合,比单条曲线更稳健。

1.3 与 ELISA、ITC 的定位

平台 输出 实时动力学 通量 典型角色
SPR (k_{\mathrm{on}}, k_{\mathrm{off}}, K_{\mathrm{D}}) Lead 表征、发表、IND
BLI 同上 初筛确认、库排序
ELISA (EC_{50}) 等 很高 杂交瘤/噬菌体初筛
ITC (K_{\mathrm{D}}, \Delta H, n) 否(平衡滴定) 热力学验证、机制

段末注释ITC(Isothermal Titration Calorimetry,等温滴定量热法) 直接测结合放热/吸热,可得焓变 (\Delta H) 与化学计量 n,但耗样大、通量低。


2. SPR:原理与机制

2.1 物理原理

SPR 基于 金属表面(通常为金膜) 上的 等离子体共振(plasmon resonance) 现象:

  1. 近表面入射 偏振光(常为近红外,~670–790 nm)。
  2. 在特定 入射角 下,光子能量耦合于金属–介质界面的 表面等离子体(surface plasmon),发生 共振吸收,反射光强度出现 极小值
  3. 界面附近存在 倏逝场(evanescent field),穿透深度约 ~200 nm——仅对该范围内的质量变化敏感。
  4. 当 analyte 结合到芯片表面固定化的 ligand 上,局部 折射率(refractive index) 升高,共振条件改变,表现为 共振角位移波长位移;仪器将其转化为 响应单位(Response Unit,RU),1 RU ≈ 表面 1 pg/mm² 的蛋白质量变化(经验换算,依分子而异)。

核心检测量:界面 光学厚度 / 折射率变化 (\propto) 结合到表面的生物分子质量。

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      入射光

╲ 倏逝场 (~200 nm)
──────────●────────── 金膜 + 羧基化葡聚糖基质
│▲▲▲ Ligand + Analyte 复合物

流动相 (analyte 溶液)

2.2 仪器与流动体系

代表平台:Cytiva Biacore 系列、Bruker Sierra SPR 等。

组件 功能
传感器芯片(Sensor chip) CM5(羧甲基葡聚糖)、NTA、SA 等化学表面
微流控通道(Flow cell) 常 2–8 通道;并行 参比通道(reference) 扣除 bulk 与非特异
注射泵 / 自动进样器 精确控制 analyte 浓度、流速、接触时间
检测单元 监测 SPR 角/波长变化 → RU

参比减法(reference subtraction):一侧固定 ligand,另一侧仅基质或空白,扣除 体折射率(bulk effect) 与非特异吸附,得到 特异性结合信号

2.3 固定化(Immobilization)化学

方法 机制 适用 注意
Amine coupling(E DC/NHS) 赖氨酸 ε-NH₂ 与活化羧基共价连接 通用蛋白 pI 附近偶联;可能遮蔽活性位点
NTA-His Ni-NTA 螯合 His-tag 重组抗原/抗体 标签取向可预测;需咪唑洗脱再生
Biotin–Streptavidin(SA) 生物素化 ligand 高亲和捕获 低 pI 蛋白、定向生物素化 SA 四价;生物素化位点影响取向
Thiol coupling 半胱氨酸巯基与金/马来酰亚胺反应 定向偶联(C 端/特定位点) 需游离 Cys 或引入 linker

取向效应:固定化可能限制 ligand 构象或 favor 某一 paratope 朝向,改变表观 (k_{\mathrm{on}})——抗体工程中常比较 Ab 固定 vs Ag 固定 或采用 Fab 片段 降低多价干扰。

2.4 实验流程

  1. 芯片预处理:缓冲液平衡至基线稳定。
  2. Ligand 固定化:达到目标 固定化水平(immobilization level)(通常 100–500 RU 量级,过高易 质量传输限制位阻)。
  3. 表面封闭:乙醇胺 等封闭残余活性基团。
  4. 动力学运行:多浓度 analyte(建议覆盖 0.1×–10× (K_{\mathrm{D}}))依次注入;结合相 60–300 s,解离相 300–1200 s(依 (k_{\mathrm{off}}) 调整)。
  5. 再生(Regeneration):低 pH Gly-HCl、MgCl₂ 等恢复表面,下一样本结合量一致。
  6. 拟合:1:1 Langmuir 全局拟合;必要时 bivalentmass transport 修正模型。

2.5 动力学方程(1:1 Langmuir)

结合相:

[
\frac{dR}{dt} = k_{\mathrm{on}} \cdot C \cdot (R_{\max} - R) - k_{\mathrm{off}} \cdot R
]

解离相((C = 0)):

[
\frac{dR}{dt} = -k_{\mathrm{off}} \cdot R
]

其中 (C) 为 analyte 体相浓度,(R_{\max}) 为饱和结合响应,(R) 为实时响应。

稳态结合量:

[
R_{\mathrm{eq}} = \frac{R_{\max} \cdot C}{K_{\mathrm{D}} + C}
]

与 ELISA 占据分数 (\theta = [Ab]/([Ab]+K_{\mathrm{D}})) 形式一致——理想 1:1 时 半数饱和浓度 = (K_{\mathrm{D}})

2.6 质量传输限制(Mass Transport Limitation,MTL)

Analyte 从体相扩散至芯片表面的速率 慢于 内在结合速率时,sensorgram 上升沿变 圆钝,高浓度区拟合 (k_{\mathrm{on}}) 偏低、(K_{\mathrm{D}}) 失真。

识别特征 缓解策略
高浓度曲线「平顶」早现、(k_{\mathrm{on}}) 随浓度漂移 提高流速;降低固定化密度;降低 analyte 浓度上限
拟合需引入 MT 系数 报告时注明;优先优化实验而非仅改模型

段末注释MTL 指 analyte 向活性表面的扩散成为限速步骤,曲线形态不再由纯化学动力学主导。


3. BLI:原理与机制

3.1 物理原理

BLI 基于 白光干涉(white-light interferometry)

  1. 生物传感器探针(biosensor tip) 末端涂覆 生物相容聚合物层(如 super streptavidin、protein A 等)。
  2. 近红外宽带光从探针内部射向 探针–溶液界面,部分反射光与 界面生物分子层 反射光发生 干涉
  3. 结合分子改变界面 光学厚度(optical thickness),干涉光谱 峰位移动(shift) 被检测,转换为 nm 或仪器单位(如 Octet 的 nm 响应)。

与 SPR 的本质差异

SPR BLI
激发 共振角/波长耦合 宽带干涉条纹位移
几何 平面芯片 + 流动 圆柱探针 + 浸泡
敏感深度 ~200 nm 倏逝场 界面分子层厚度
样品 需注入流动相 Dip-and-read,可直接测粗样品
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探针杆


┌───┐ ◄── 干涉光路
│ ▓▓│ 生物分子层 (Ligand + Analyte)
└───┘

~~~~~~ 样品孔(96/384 孔板)

3.2 仪器与探针体系

代表平台:Sartorius Octet(原 ForteBio)系列。

组件 功能
Biosensor SA、NTA、Protein A、Anti-hIgG Fc 等预涂层探针
探针架 最多 8–16 根并行浸泡不同孔
微孔板 96/384 孔;每孔 200 μL 量级
温控与振荡 减少传质梯度;维持 25/30/37 °C

Dip-and-read 工作流:探针浸入 缓冲液 → 基线 → 浸入 analyte 孔(结合)→ 回到 缓冲液(解离)→ 再生孔(可选)→ 下一浓度循环。

3.3 固定化策略

与 SPR 概念类似,但 探针化学 不同:

探针类型 捕获方式
SA(Streptavidin) 生物素化 ligand
NTA His-tag 蛋白
Protein A / G Fc 捕获 IgG
Amine-reactive(AR2G 等) 共价偶联

Protein A 捕获 IgG:快速但 Fc 取向固定、且 IgG 为 二价 analyte——测全抗时常需 bivalent 模型 或改用 Fab/抗原固定 策略。

3.4 实验流程与参数

  1. 探针浸润:缓冲液中平衡至基线漂移 < 0.05 nm/min。
  2. Ligand 加载:将探针浸入含 ligand 的孔,至目标加载量(通常 0.5–2.0 nm shift)。
  3. 结合:浸入 analyte 梯度孔 60–300 s。
  4. 解离:缓冲液中 60–600 s。
  5. 再生:如 10 mM Gly-HCl pH 1.7,或 SDS(依化学耐受性)。
  6. 拟合:Octet 软件或全局分析工具,1:1 或 bivalent 模型。

浓度系列:至少 4–5 个有效浓度点;高亲和力((k_{\mathrm{off}}) 极小)需 延长解离时间 以可靠拟合 (k_{\mathrm{off}})。

3.5 BLI 特有现象

现象 机制 应对
蒸发 / 弯液面 长时间孔板开放,液面下降改变光路 加盖、矿物油覆盖、控湿
孔间交叉污染 探针携带液滴 洗涤孔充分浸泡、降低携带体积
非特异吸附 粗样品中杂蛋白粘附探针 加 BSA/Tween;参比探针;稀释样品
搅拌/传质 孔内扩散慢于 SPR 流动 提高振荡;延长结合时间

4. SPR 与 BLI 对比

4.1 核心指标对比

维度 SPR BLI
灵敏度 极高(低 pM–nM (K_{\mathrm{D}}) 可测) 良好(通常 nM–μM 更稳;极强结合需长解离)
动力学分辨率 可分辨 (k_{\mathrm{off}} \sim 10^{-6}) s(^{-1}) 量级 略低;快速事件与长解离需优化设计
样品基质耐受 要求较洁净;浊液/颗粒干扰大 耐受细胞上清、血清、DMSO 等更宽容
耗样量 通常需数十–数百 μL 流动 孔板 200 μL/孔;可更低体积
通量 1–8 通道串行,日测数十样品 8–16 探针并行,日测数百 更可行
自动化 高(Biacore 8K+ 等) 高(384 孔板兼容)
设备与耗材成本 仪器与芯片成本高 探针可重复使用次数有限,但初筛性价比高
固定化灵活性 化学偶联种类丰富 预涂层探针为主,自定义偶联选项较少
文献认可度 最高(监管与发表首选) 高(筛选与并行表征);部分审稿人要求 SPR 复核

4.2 优势汇总

SPR 优势

  • 动力学数据 精度与分辨率 业界标杆,适合 (k_{\mathrm{off}}) 极小 的高亲和力抗体。
  • 流动相 传质可控,MTL 可系统表征与校正。
  • 参比通道 与成熟软件生态(Biacore Insight Evaluation 等)。
  • 监管申报(IND/BLA)中 SPR (K_{\mathrm{D}}) 接受度最高。

BLI 优势

  • 通量高、上手快:杂交瘤/噬菌体库 hit confirmation 理想。
  • 粗样品友好:可直接测表达上清,减少纯化步骤。
  • 无微流控堵塞 风险;维护相对简单。
  • 耗材按 探针次 计费,初筛 成本结构 更灵活。

4.3 共同局限

局限 说明
固定化取向 Ligand 活性位点是否暴露;Amine coupling 随机取向
价态 / Avidity IgG 二价 analyte 使 1:1 模型失效 → (K_{\mathrm{D,app}})
再生不完全 表面活性下降、历史结合记忆
非特异结合 杂蛋白、缓冲组分吸附于表面/探针
缓冲液匹配 体相与运行缓冲折射率/粘度差异 → 漂移
强结合 (k_{\mathrm{off}}) 解离过慢,需外推或改用 稳态法 估 (K_{\mathrm{D}})
弱结合 (K_{\mathrm{D}} > \mu)M 时信号弱、噪声占比大

5. 实验设计要点(抗体场景)

5.1 谁固定、谁流动?

策略 适用 风险
Ag 固定,Ab 为 analyte 常规亲和力排序 高浓度 Ab 聚集
Ab 固定,Ag 为 analyte 多克隆比较同一抗原 抗体取向不均
Fab + 单体 Ag 单价 (K_{\mathrm{D}}) 金标准 表达与制备成本
IgG 固定(Protein A) 快速测 Ag 结合 Bivalent 模型必须

5.2 单价 (K_{\mathrm{D}}) 的推荐条件

抗体-02.指标-02 §2.4 一致:

  1. Fab / Fv单体抗原 + 明确价态模型
  2. 抗原 可溶性、构象均一(非膜蛋白聚集体)。
  3. 固定化水平 适中(SPR 100–500 RU;BLI 0.5–1.5 nm)。
  4. 温度、pH、离子强度 标注并与体内相关条件对照
  5. 至少 一次反向固定化(swap orientation)验证趋势一致。

5.3 亲和力分级(经验)

(K_{\mathrm{D}}) 范围 结合强度 SPR/BLI 注意
< 1 nM 很高 解离相需 ≥ 600–1800 s;BLI 长解离占孔时间
1–100 nM 高(治疗抗体常见) 标准动力学设计
100 nM – 1 μM 中等 可提高 analyte 浓度
> 1 μM 信号弱;考虑 ITC 或稳态法

6. 数据拟合与质量控制

6.1 模型选择

模型 适用场景
1:1 Langmuir Fab–单体 Ag
Bivalent analyte IgG 为 analyte、单价 Ag 固定
Heterogeneous ligand 固定化不均一、多表位
Mass transport 高 RU、高 (k_{\mathrm{on}}) 时 MTL 明显

6.2 质量检查清单

  • 基线漂移 < 5 RU/min(SPR)或 < 0.05 nm/min(BLI)
  • 参比/空白扣除后,低浓度曲线信噪比足够
  • 解离相拟合残差随机,无系统性弯曲(否则换模型或查再生)
  • (k_{\mathrm{off}}) 与解离相时长匹配:(t_{\mathrm{diss}} \gtrsim 5/k_{\mathrm{off}})
  • 再生后下一循环结合量恢复 ≥ 90%
  • 浓度系列覆盖 (K_{\mathrm{D}}) 两侧

6.3 常见拟合失败原因

现象 可能原因
(k_{\mathrm{on}}) 随浓度系统性变化 MTL;固定化过高
解离相几乎平坦但 ELISA 很强 (k_{\mathrm{off}}) 太小,解离时间不够
结合不饱和 浓度范围不足;活性 analyte 比例低
高浓度响应下降 聚集、沉淀、非特异竞争
重复运行漂移 再生损伤;探针老化(BLI)

7. 抗体研发中的典型工作流

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[库筛选]     ELISA / FACS → EC50 排序(高通量)
↓ top hits
[命中确认] BLI 多克隆并行 → KD 粗测 + kon/koff 趋势(省纯化)
↓ lead 克隆
[精细表征] SPR(Fab–Ag 1:1)→ 发表/IND 级 KD
↓ 可选
[热力学] ITC 验证 ΔH、化学计量 n

[表位分组] SPR/BLI binning(竞争结合)→ 表位多样性

Binning(表位分组):固定抗原,先饱和结合 Ab1,再注入 Ab2;若 Ab2 仍结合则为 不同表位——与亲和力测定共用平台,但读数为 竞争格局 而非 (K_{\mathrm{D}})。


8. 报告规范(SPR/BLI 专用补充)

抗体-02.指标-02 §8.1 基础上,建议补充:

字段 SPR 示例 BLI 示例
仪器 Biacore 8K Octet R8
芯片/探针 CM5, SA SA, Protein A
固定化 Ag amine coupling, 280 RU Biotinylated Ag, 1.2 nm
流向 Ab 为 analyte, 30 μL/min 结合 120 s, 解离 600 s
模型 1:1 global 1:1 global
结果 (k_{\mathrm{on}}=2.1\times10^{5}) M(^{-1})s(^{-1}), (k_{\mathrm{off}}=3.2\times10^{-4}) s(^{-1}), (K_{\mathrm{D}}=1.5) nM 同左

禁止:仅报告「亲和力 < 1 nM」而无 (k_{\mathrm{on}}/k_{\mathrm{off}});将 IgG bivalent 拟合结果标为 单价 (K_{\mathrm{D}}) 而不注明模型。


9. 小结

主题 SPR BLI
原理 金膜表面等离子体共振 → 折射率变化 → RU 探针端干涉光谱位移 → nm
机制 微流控注入、平面芯片、参比减法 孔板浸泡、dip-and-read
强项 动力学精度、监管认可、极强结合 通量、粗样品、操作简便
弱项 成本高、样品洁净度、MTL 极强/极弱结合边界、探针耗材
抗体实践 Lead 与注册 (K_{\mathrm{D}}) 首选 库确认与并行排序首选

二者互补:BLI 筛、SPR 定 是工业界常见组合。无论平台,报告 (K_{\mathrm{D}}) 时必须交代 固定化化学、分子格式、拟合模型与溶液条件,并与 ELISA (EC_{50}) 区分使用——计算训练与文献对比方可 reproducible。


延伸阅读

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