Software-变异注释-spliceAI

SpliceAI gitlab
SpliceAI paper

软件介绍

软件的部署适用

spliceAI 是一个基于python的软件,可以通过conda或者pip进行安装,安装方式如下:

1
2
3
4
5
pip install spliceai
# or
conda install -c bioconda spliceai

conda create -n spliceAI -c bioconda spliceai

软件本身分析速度较慢,预计一个变异耗时1s 左右。

结果说明

预测:11: 47364709 C>T 为例,

SpliceAI=G|OR4F5|0.01|0.08|0.00|0.00|-10|26|-28|-25

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参考来源

原件的原理介绍

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