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常用shell命令 - sz/rz

发表于 2018-07-08 | 分类于 Linux
lrzsz 是一款linux下命令行界面上支持上传和下载的第三方工具,能够起到很方便的作用。
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常用数据库目录

发表于 2018-06-23 | 分类于 知识沉淀 , 数据库 , 肿瘤
1. COSMIC癌症相关的体细胞位点,是整个网站的核心,收录了来自不同研究机构和数据库的体细胞突变数据,并提供了方便的浏览,检索,下载功能。 2. Cell Lines Project对癌症研究中常用的细胞系样本进行深入研究,分析其突变信息。相比COSMIC, 整个项目中涵盖的变异数据会少一点。 ...
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常用数据库 - Cancer Hotspots

发表于 2018-06-23 | 分类于 知识沉淀 , 数据库 , 肿瘤
This resource is maintained by the Kravis Center for Molecular Oncology at Memorial Sloan Kettering Cancer Center. It provides information about statistically significantly recurrent mutations identified in large scale cancer genomics data.
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流程图绘制 - diagrams

发表于 2018-06-05 | 分类于 software , Windows , Mac
安装Web在线版本 本地版安装 支持Windows、Mac、Linux等。 也可以使用 VS code进行相关流程图的绘制,需要安装Draw.io VS Code Integration 扩展。 介绍软件的使用,都是可以通过UI进行拖拽操作的,因此整体使用较为简单,在此不进行赘述。但是在此稍微介绍一 ...
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变异注释功能标准化 - Sequence Ontology

发表于 2018-06-05 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , 标准化
参考资料参考网站新版网站github网址 为什么要标准化?
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肿瘤NGS检测方法开发方法学 - MSK方法学资料

发表于 2018-06-05 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , 方法学
参考资料EVALUATION OF AUTOMATIC CLASS III DESIGNATION FOR MSK-IMPACT (Integrated Mutation Profiling of Actionable Cancer Targets)A Hybridization Capture-B ...
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变异检出标准化-HGVS (Human Genome Variation Society)

发表于 2018-06-05 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , 标准化
在肿瘤分析中,包括对其他的数据样本进行重测序分析的过程中,变异检测的第一步就是需要进行序列的比对,然后根据比对结果进行变异检测,但是如果不进行标准化,会导致一些发生在重复区域的缺失等不能很好的
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变异检出标准化-HGVS

发表于 2018-06-05 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , 标准化
在肿瘤分析中,包括对其他的数据样本进行重测序分析的过程中,变异检测的第一步就是需要进行序列的比对,然后根据比对结果进行变异检测,但是如果不进行标准化,会导致一些发生在重复区域的缺失等不能很好的
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Software-Mac环境管理软件-Homebrew简介和基本使用

发表于 2018-05-15 | 分类于 software , Mac
使用 Homebrew 安装Mac没有预装但你需要的东西。Homebrew的安装及使用简介。
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两组数据差异显著性检验

发表于 2018-05-02 | 分类于 统计知识
数据分析过程中,很多时候,主管的感受会存在偏差,利用统计学方法比较数据(组)的差异是否具有显著性,具有重要的应用价值。
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