MSI检测及相关共识
摘要微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)由DNA错配修复(mismatch repair,MMR)蛋白功能缺陷导致,这一分子特征在结直肠癌和子宫内膜癌等相关实体瘤中具有重要的临床意义。目前检测MSI状态的手段包括免疫组织化学检测MMR蛋白、多重荧光聚合酶链反
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肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020年版)
共识原文链接2020.10 肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020年版)肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)作为一个新兴的生物标志物,在预测肿瘤免疫治疗疗效中的作用越来越受到重视。目前 TMB 的检测方法主要是基于高通量测序平台的全外显子测序和靶向 Pan
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共识-肿瘤二代测序临床报告解读共识
参考原文循证医学官网:肿瘤二代测序临床报告解读共识肿瘤二代测序临床报告解读共识.pdf
随着新型治疗药物的研发以及多学科综合治疗模式的优化,传统的病理分型及检测方法已经不足以满足临床需求,二代测序(next generation sequencing,NGS)已成为中国肿瘤医生常用的检测手段。为进一
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Python-包-python-pptx生成PPT
简介处于某些上下游对接需求,所以需要频繁的将生信的分析结果整理成PPT文件,以便进行结果的展示。所以基于该模块可以更方便的在集群上自动化生成相关的文档示例,用于进行后续的处理。
使用python操作PPT,需要使用的模块就是python-pptx,下面来对该模块做一个简单的介绍。这里提前做一个说明:
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Characterization and mitigation of fragmentation enzyme-induced dual stranded artifacts
DNA片段化是基于杂交捕获的短读长测序文库制备过程中的基本步骤。文库制备包括DNA片段化过程中引入的错误,会显著影响下游的分析,并直接导致假阳性和假阴性的增加。目前主流的DNA片段化方法有两种: 基于超声波进行的物理打断,(超声打断本身比较昂贵(仪器上万)和耗时(每个样本几分钟),但是会带来一些样本
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