NGS测序原理 发表于 2018-04-27 | 分类于 NGS , 原理 信息分析,多数是基于不同的测序数据进行的,而数据的提取,建库、扩增、杂交、测序过程,往往我们不会直接进行参与,但是理解这些过程的原理,可以帮助我们更清楚的理清楚整个数据获取过程,了解数据产生的过程,才能更好的在数据分析师有针对性的处理一些偏好性等相关的问题,提高我们对数据的理解能力。 阅读全文 »
hexo博客文章优化 发表于 2018-04-19 | 分类于 hexo 博客文章添加折叠功能博客文章中,有些内容篇幅较大,但是可能对一部分读者来说,并不会特别关注,所以这些数据的展示,可能会直接导致整篇博文变得臃肿,而对另一部分读者,这部分详细的介绍却非常重要,因此不能简单的缩减博文,所以这个时候,针对文章中这部分篇幅较大的内容,增加折叠功能可以很好的解决这类问题。 在 ... 阅读全文 »
Linux配置文件~/.bashrc设置 发表于 2018-04-13 | 分类于 Linux 一个好的Linux环境配置可以显著的提高我们的工作效率,改善我们的工作环境,所以在这里记录下一些常用的配置设置,同时也记录下一下常见问题的解决方案。 阅读全文 »
BASH的基本语法 发表于 2018-04-13 | 分类于 Linux Bash是多数Linux发行版本的默认shell,不同的shell之间的基本语法是相通的,通过学习bash,可以让我们对不同的shell都有一个基本的了解。 阅读全文 »
samtools-安装 发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , Linux Samtools在Linux环境下的安装过程记录,因为是初始开始安装,缺少多个依赖,所以记录下来以备后用。 阅读全文 »
CNV检测-调研 发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , 编程拾慧 , Linux , R Detection of Exon Copy Number variants (DECoN) 是一款CNV检测工具,适用于exon-based的panel测序,可以识别single exon CNV 阅读全文 »
GATK4初探 - 1 发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , Linux GATK是信息分析中,进行变异检测的常规软件,目前GATK4正式版已经推出,因此,了解和学习GATK4的使用,对变异检测的整个过程具有非常大的帮助。 阅读全文 »
CNV检测-DECoN 发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , 编程拾慧 , Linux , R Detection of Exon Copy Number variants (DECoN) 是一款CNV检测工具,适用于exon-based的panel测序,可以识别single exon CNV 阅读全文 »