Python包-Numpy记录
官方文档
模块的安装1pip install pyvcf
安装可能的异常记录Error1pyvcf的最新版（0.6.8）安装需要使用use_2to3 （在setuptools>=58 后不支持该参数）所以需要对setuptools进行版本调整，过高过低都会出现该参数缺失无法变异的情况。1pip
...
Python包-rich
Rich is a Python library for writing rich text (with color and style) to the terminal, and for displaying advanced content such as tables, markdown, a
...
变异检出标准化-HGVS
在肿瘤分析中，包括对其他的数据样本进行重测序分析的过程中，变异检测的第一步就是需要进行序列的比对，然后根据比对结果进行变异检测，但是如果不进行标准化，会导致一些发生在重复区域的缺失等不能很好的
肿瘤NGS检测方法开发方法学 - MSK方法学资料
参考资料EVALUATION OF AUTOMATIC CLASS III DESIGNATION FOR MSK-IMPACT (Integrated Mutation Profiling of Actionable Cancer Targets)A Hybridization Capture-B
...
变异检出标准化-HGVS (Human Genome Variation Society)
在肿瘤分析中，包括对其他的数据样本进行重测序分析的过程中，变异检测的第一步就是需要进行序列的比对，然后根据比对结果进行变异检测，但是如果不进行标准化，会导致一些发生在重复区域的缺失等不能很好的
流程图绘制 - diagrams
安装Web在线版本
本地版安装 支持Windows、Mac、Linux等。
也可以使用 VS code进行相关流程图的绘制，需要安装Draw.io VS Code Integration 扩展。
介绍软件的使用，都是可以通过UI进行拖拽操作的，因此整体使用较为简单，在此不进行赘述。但是在此稍微介绍一
...
R绘图 - ggplot常用参数记录
数据读取如果计划使用ggplot绘图，推荐使用数列方式整理数据，数据之间用tab分割。读取后，默认是数据框格式。然后然后根据所要绘制的图片，对数据进行解析。
折叠代码示例
Type
Cancer
TMB
Plasma
hepatocellular_carcinoma
9.7435897
...