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密钥设置实现免密码访问

发表于 2018-04-19 | 分类于 环境配置
设计免密码进行节点切换
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R绘图-ggplot-箱线图绘制

发表于 2018-04-18 | 分类于 编程拾慧 , R
数据处理过程中,好的数据展示,可以帮助我们更好的理解数据,发现数据之间的关系,记录下各种常见的绘图方式。 结果示例箱线图上方标注的为每个样品对应的中位数,可以根据需要进行调整。 绘图命令1Rscript ../ggplot_boxplot.R -i ggplot_boxplot.demo.data ...
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Linux配置文件~/.bashrc设置

发表于 2018-04-13 | 分类于 Linux
一个好的Linux环境配置可以显著的提高我们的工作效率,改善我们的工作环境,所以在这里记录下一些常用的配置设置,同时也记录下一下常见问题的解决方案。
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BASH的基本语法

发表于 2018-04-13 | 分类于 Linux
Bash是多数Linux发行版本的默认shell,不同的shell之间的基本语法是相通的,通过学习bash,可以让我们对不同的shell都有一个基本的了解。
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samtools-安装

发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , Linux
Samtools在Linux环境下的安装过程记录,因为是初始开始安装,缺少多个依赖,所以记录下来以备后用。
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R安装

发表于 2018-04-09 | 分类于 环境配置 , 编程拾慧 , R
R在Linux环境下的安装过程记录,因为是初始开始安装,缺少多个依赖,所以记录下来以备后用。
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GATK4初探 - 1

发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , Linux
GATK是信息分析中,进行变异检测的常规软件,目前GATK4正式版已经推出,因此,了解和学习GATK4的使用,对变异检测的整个过程具有非常大的帮助。
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Software-MANTIS调研

发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , Linux
MSI(Microsatellite instability 微卫星不稳定),在MMR缺陷的基因组中,MSI发生的比例会显著提升。MANTIS 就是一个用于进行MSI检测的软件。
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CNV检测-调研

发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , 编程拾慧 , R , Linux
调研已发表的工具和市场上的相关竞品,整理现有ExonCNV检测方法的性能表现。
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CNV检测-DECoN

发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , 编程拾慧 , R , Linux
Detection of Exon Copy Number variants (DECoN) 是一款CNV检测工具,适用于exon-based的panel测序,可以识别single exon CNV
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