snakemake进阶 - 扩展自定义参数进行流程控制
分支的实现在进行snakemake分析时，所有的参数都是通过 -C 进行传递的，例如 -C S=”string” 则在smk中可以通过使用 config[‘S’] 调用相关参数完成参数传递。 -C 传递的值统一保存在字典 “config” 中。
1234567-C \# 指定一些分支
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SGE任务调度系统相关命令记录
http://gridscheduler.sourceforge.net/htmlman/http://gridscheduler.sourceforge.net/htmlman/htmlman1/qstat.html?pathrev=V62u5_TAG
sge系统管理命令队列信息查询
命令
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天河二号作业调度系统简单使用
发表于
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分类于
任务调度
天河用户手册天河用户手册现将天河2号的作业调度系统的简单使用方法记录于此:
MPI天河2号默认使用mpich-3.2.1（使用icc-14.0.2 编译），是天河2号自主实现的mpi版本，具有较高的效率。
module 模块管理1234module avail # 查看
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爬虫学习记录-相关软件&包记录
爬虫学习过程涉及的软件：
软件1. Python3.5.5整体爬虫代码的框架语言，所有Python程序及包均基于本版本。
2. chromeDriver模拟登陆chrome浏览器，驱动浏览器完成相关操作。
3.PhantomJS - 官方文档一个无界面的，可脚本编程的WebKit浏览器引擎，原生支持
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下机数据(fastq)质控软件汇总
下机数据质控，是NGS数据分析中的第一步，因此也是接触二代测序所必须学习的一部分，今天主要在这里记录下一些主流的数据质控软件，后续有时间，也可以考虑对这些数据进行一个系统的评估。