常用shell命令 - time 发表于 2018-10-08 | 分类于 Linux time是linux内置的一个计算统计任务运行时间的命令，同时还可以统计任务运行的内存、I/O资源。 阅读全文 »
参考基因组版本问题汇总 发表于 2018-07-11 | 分类于 知识沉淀 ， NGS ， 数据库 ， 肿瘤检测 不同版本参考基因组的位置坐标转换在使用参考基因组时，经常会遇到一些版本的问题，比如使用注释文件和bed文件时，不同版本的位置坐标不能直接使用，这时候，我们就需要对坐标进行转换，这里记录下一些常用的坐标转换工具： 类型 支持格式 地址 推荐指数 Liftover 在线 bed http: ... 阅读全文 »
常用数据库目录 发表于 2018-06-23 | 分类于 知识沉淀 ， 数据库 ， 肿瘤 1. COSMIC癌症相关的体细胞位点，是整个网站的核心，收录了来自不同研究机构和数据库的体细胞突变数据，并提供了方便的浏览，检索，下载功能。 2. Cell Lines Project对癌症研究中常用的细胞系样本进行深入研究，分析其突变信息。相比COSMIC, 整个项目中涵盖的变异数据会少一点 ... 阅读全文 »